I Jönköpings län finns ett regionalt förenings- och folkrörelsearkiv: Jönköpings läns folkrörelsearkiv (JFA) som samlar in, förvarar och tillhandahåller handlingar, trycksaker och föremål från länets folkrörelser och föreningar. I sitt ordnade arkivbestånd har JFA runt 5000 arkivbildare. Materialet ordnas och förtecknas på ett professionellt vis innan allmänheten kan ta del av det i Arkivhusets forskarsal.

I Jönköpings läns museums arkiv har man under 1900-talet samlat information om länets historia. Ett av arkiven är uppordnat efter länets kommuner och församlingar. Dessutom är samlingen ordnad efter ämnen som företag, kommunikationer, fornminnen, Smålands-konstnärer, personhistoria och så vidare.

Länet har ett rikt musikliv och under ca ett decennium har JLM samlat in material till sitt pop- och rockarkiv, bestående av tidningsartiklar, affischer, vinylskivor och cd-skivor.

Det finns även ett enskilt arkiv med handlingar från föreningar, företag och personer.

Ute i länet förekommer även flera olika lokala arkiv, exempelvis hembygdsarkiv och flera gårds- och släktarkiv samt privatpersoners arkiv.